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生物計(jì)算--生物序列的分析方法與應(yīng)用/數(shù)學(xué)與現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)叢書
生物計(jì)算--生物序列的分析方法與應(yīng)用/數(shù)學(xué)與現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)叢書
作者：楊晶
開本：
16開
頁數(shù)：
380
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生物計(jì)算--生物序列的分析方法與應(yīng)用/數(shù)學(xué)與現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)叢書 版權(quán)信息
- ISBN：9787030263933
- 條形碼：9787030263933 ; 978-7-03-026393-3
- 裝幀：暫無
- 冊(cè)數(shù)：暫無
- 重量：暫無
- 所屬分類：>>
生物計(jì)算--生物序列的分析方法與應(yīng)用/數(shù)學(xué)與現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)叢書 內(nèi)容簡(jiǎn)介
以較通俗的語言撰寫"生物信息學(xué)與生物計(jì)算學(xué)"中的有關(guān)算法原理、計(jì)算步驟、使用方法與應(yīng)用問題。重點(diǎn)討論了生物序列的比對(duì)分析算法和原理；生物序列語義分析；基因識(shí)別和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)等問題的算法和原理，以及基因芯片的數(shù)據(jù)分析方法介紹。并將相應(yīng)問題的軟件使用做了介紹。
生物計(jì)算--生物序列的分析方法與應(yīng)用/數(shù)學(xué)與現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)叢書 目錄
《數(shù)學(xué)與現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)叢書》序 前言
**部分 基本方法
第1章 生物序列突變與比對(duì)分析
1.1 生物序列突變與比對(duì)問題
1.1.1 生物序列的類型與結(jié)構(gòu)
1.1.2 生物序列突變與比對(duì)問題的意義與應(yīng)用
1.1.3 生物序列比對(duì)的原理與方法
1.2 二重序列比對(duì)的有關(guān)算法
1.2.1 關(guān)于動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法的一些說明
1.2.2 動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法
1.2.3 統(tǒng)計(jì)判決算法的基本思想
1.2.4 BLAST軟件的使用
1.3 多重序列的比對(duì)問題
1.3.1 MSA的意義與概況
1.3.2 MSA的定義與優(yōu)化準(zhǔn)則
1.4 MSA算法與計(jì)算
1.4.1 MSA算法的基本概念
1.4.2 MSA的算法步驟
1.4.3 ClustalW軟件的使用
1.4.4 關(guān)于MSA的幾點(diǎn)說明
1.4.5 幾個(gè)多重序列比對(duì)應(yīng)用例子
1.5 SPA算法的原理與計(jì)算
1.5.1 SPA算法的基本原理
1.5.2 SPA算法的基本步驟
1.5.3 SPA算法源碼
1.5.4 SPA算法的有關(guān)問題討論
1.5.5 SPA算法的一個(gè)實(shí)例計(jì)算
習(xí)題與思考
第2章 系統(tǒng)發(fā)育分析
2.1 分子系統(tǒng)發(fā)育分析的基本概念
2.2 基于距離的方法
2.2.1 非加權(quán)分組平均法
2.2.2 鄰接法
2.3 基于特征的方法
2.4 極大似然和Bayes方法
2.4.1 進(jìn)化的概率論模型
2.4.2 構(gòu)建進(jìn)化樹的極大似然方法
2.4.3 構(gòu)建進(jìn)化樹的Bayes方法
2.5 構(gòu)建進(jìn)化樹軟件簡(jiǎn)介
習(xí)題與思考
第3章 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的語義分析
3.1 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的信息與統(tǒng)計(jì)分析法
3.1.1 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的語義分析簡(jiǎn)介
3.1.2 信息、統(tǒng)計(jì)分析法的要素與要點(diǎn)
3.1.3 局部詞的定義與判定
3.1.4 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的語義分析
3.2 蛋白質(zhì)序列語義結(jié)構(gòu)的組合分析法
3.2.1 關(guān)于組合圖論的有關(guān)記號(hào)
3.2.2 數(shù)據(jù)庫的復(fù)雜度
3.2.3 數(shù)據(jù)庫的關(guān)鍵詞與核心詞.
3.2.4 關(guān)于組合分析的若干應(yīng)用問題
習(xí)題與思考
第4章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
4.1 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
4.1.1 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的評(píng)價(jià)體系
4.1.2 Chou-Fasman方法
4.1.3 GOR方法
4.1.4 PHD方法
4.2 蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
4.2.1 同源序列搜索
4.2.2 折疊識(shí)別方法
4.2.3 從頭預(yù)測(cè)方法
4.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)軟件簡(jiǎn)介
4.3.1 PHD軟件使用簡(jiǎn)介
4.3.2 使用nnpredict軟件預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu) ……
第5章 基因識(shí)別
第6章 基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析
第二部分 生物學(xué)備忘錄
第7章 核酸與DNA
第8章 氨基酸與蛋白質(zhì)
第9章 基因與基因組
第10章 生物信息數(shù)據(jù)庫
第三部分 數(shù)學(xué)備忘錄
第11章 智能計(jì)算理論與算法
第12章 概率、信息與統(tǒng)計(jì)
第13章 隨機(jī)過程
第14章 有關(guān)圖與樹的基本知識(shí)
參考文獻(xiàn)
索引
《數(shù)學(xué)與現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)叢書》已出版書目
**部分 基本方法
第1章 生物序列突變與比對(duì)分析
1.1 生物序列突變與比對(duì)問題
1.1.1 生物序列的類型與結(jié)構(gòu)
1.1.2 生物序列突變與比對(duì)問題的意義與應(yīng)用
1.1.3 生物序列比對(duì)的原理與方法
1.2 二重序列比對(duì)的有關(guān)算法
1.2.1 關(guān)于動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法的一些說明
1.2.2 動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法
1.2.3 統(tǒng)計(jì)判決算法的基本思想
1.2.4 BLAST軟件的使用
1.3 多重序列的比對(duì)問題
1.3.1 MSA的意義與概況
1.3.2 MSA的定義與優(yōu)化準(zhǔn)則
1.4 MSA算法與計(jì)算
1.4.1 MSA算法的基本概念
1.4.2 MSA的算法步驟
1.4.3 ClustalW軟件的使用
1.4.4 關(guān)于MSA的幾點(diǎn)說明
1.4.5 幾個(gè)多重序列比對(duì)應(yīng)用例子
1.5 SPA算法的原理與計(jì)算
1.5.1 SPA算法的基本原理
1.5.2 SPA算法的基本步驟
1.5.3 SPA算法源碼
1.5.4 SPA算法的有關(guān)問題討論
1.5.5 SPA算法的一個(gè)實(shí)例計(jì)算
習(xí)題與思考
第2章 系統(tǒng)發(fā)育分析
2.1 分子系統(tǒng)發(fā)育分析的基本概念
2.2 基于距離的方法
2.2.1 非加權(quán)分組平均法
2.2.2 鄰接法
2.3 基于特征的方法
2.4 極大似然和Bayes方法
2.4.1 進(jìn)化的概率論模型
2.4.2 構(gòu)建進(jìn)化樹的極大似然方法
2.4.3 構(gòu)建進(jìn)化樹的Bayes方法
2.5 構(gòu)建進(jìn)化樹軟件簡(jiǎn)介
習(xí)題與思考
第3章 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的語義分析
3.1 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的信息與統(tǒng)計(jì)分析法
3.1.1 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的語義分析簡(jiǎn)介
3.1.2 信息、統(tǒng)計(jì)分析法的要素與要點(diǎn)
3.1.3 局部詞的定義與判定
3.1.4 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的語義分析
3.2 蛋白質(zhì)序列語義結(jié)構(gòu)的組合分析法
3.2.1 關(guān)于組合圖論的有關(guān)記號(hào)
3.2.2 數(shù)據(jù)庫的復(fù)雜度
3.2.3 數(shù)據(jù)庫的關(guān)鍵詞與核心詞.
3.2.4 關(guān)于組合分析的若干應(yīng)用問題
習(xí)題與思考
第4章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
4.1 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
4.1.1 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的評(píng)價(jià)體系
4.1.2 Chou-Fasman方法
4.1.3 GOR方法
4.1.4 PHD方法
4.2 蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
4.2.1 同源序列搜索
4.2.2 折疊識(shí)別方法
4.2.3 從頭預(yù)測(cè)方法
4.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)軟件簡(jiǎn)介
4.3.1 PHD軟件使用簡(jiǎn)介
4.3.2 使用nnpredict軟件預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu) ……
第5章 基因識(shí)別
第6章 基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析
第二部分 生物學(xué)備忘錄
第7章 核酸與DNA
第8章 氨基酸與蛋白質(zhì)
第9章 基因與基因組
第10章 生物信息數(shù)據(jù)庫
第三部分 數(shù)學(xué)備忘錄
第11章 智能計(jì)算理論與算法
第12章 概率、信息與統(tǒng)計(jì)
第13章 隨機(jī)過程
第14章 有關(guān)圖與樹的基本知識(shí)
參考文獻(xiàn)
索引
《數(shù)學(xué)與現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)叢書》已出版書目
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