���] ����Ӌ(j��)��--�������еķ��������c��(y��ng)��/��(sh��)�W(xu��)�c�F(xi��n)���ƌW(xu��)���g(sh��)����

����(sh��)�W(xu��)�c�F(xi��n)���ƌW(xu��)���g(sh��)�������� ǰ��
**���� ��������
��1�� ��������ͻ׃�c�Ȍ�(du��)����
1.1 ��������ͻ׃�c�Ȍ�(du��)���}
1.1.1 �����������c�Y(ji��)��(g��u)
1.1.2 ��������ͻ׃�c�Ȍ�(du��)���}�����x�c��(y��ng)��
1.1.3 �������бȌ�(du��)��ԭ���c����
1.2 �������бȌ�(du��)�����P(gu��n)�㷨
1.2.1 �P(gu��n)�ڄ�(d��ng)�B(t��i)Ҏ(gu��)���㷨��һЩ�f��
1.2.2 ��(d��ng)�B(t��i)Ҏ(gu��)���㷨
1.2.3 �y(t��ng)Ӌ(j��)�ЛQ�㷨�Ļ���˼��
1.2.4 BLASTܛ����ʹ��
1.3 �������еıȌ�(du��)���}
1.3.1 MSA�����x�c�śr
1.3.2 MSA�Ķ��x�c��(y��u)����(zh��n)�t
1.4 MSA�㷨�cӋ(j��)��
1.4.1 MSA�㷨�Ļ�������
1.4.2 MSA���㷨���E
1.4.3 ClustalWܛ����ʹ��
1.4.4 �P(gu��n)��MSA���c(di��n)�f��
1.4.5 �ׂ�(g��)�������бȌ�(du��)��(y��ng)������
1.5 SPA�㷨��ԭ���cӋ(j��)��
1.5.1 SPA�㷨�Ļ���ԭ��
1.5.2 SPA�㷨�Ļ������E
1.5.3 SPA�㷨Դ�a
1.5.4 SPA�㷨�����P(gu��n)���}ӑՓ
1.5.5 SPA�㷨��һ��(g��)��(sh��)��Ӌ(j��)��
��(x��)�}�c˼��
��2�� ϵ�y(t��ng)�l(f��)������
2.1 ����ϵ�y(t��ng)�l(f��)�������Ļ�������
2.2 ���ھ��x�ķ���
2.2.1 �Ǽә�(qu��n)�ֽMƽ����
2.2.2 ���ӷ�
2.3 ���������ķ���
2.4 �O����Ȼ��Bayes����
2.4.1 �M(j��n)���ĸ���Փģ��
2.4.2 ��(g��u)���M(j��n)����ĘO����Ȼ����
2.4.3 ��(g��u)���M(j��n)�����Bayes����
2.5 ��(g��u)���M(j��n)����ܛ������
��(x��)�}�c˼��
��3�� �����|(zh��)һ��(j��)�Y(ji��)��(g��u)���Z�x����
3.1 �����|(zh��)һ��(j��)�Y(ji��)��(g��u)����Ϣ�c�y(t��ng)Ӌ(j��)������
3.1.1 �����|(zh��)һ��(j��)�Y(ji��)��(g��u)���Z�x��������
3.1.2 ��Ϣ���y(t��ng)Ӌ(j��)��������Ҫ���cҪ�c(di��n)
3.1.3 �ֲ��~�Ķ��x�c�ж�
3.1.4 �����|(zh��)һ��(j��)�Y(ji��)��(g��u)���Z�x����
3.2 �����|(zh��)�����Z�x�Y(ji��)��(g��u)�ĽM�Ϸ�����
3.2.1 �P(gu��n)�ڽM�ψDՓ�����P(gu��n)ӛ̖(h��o)
3.2.2 ��(sh��)��(j��)��ď�(f��)�s��
3.2.3 ��(sh��)��(j��)����P(gu��n)�I�~�c�����~.
3.2.4 �P(gu��n)�ڽM�Ϸ��������ɑ�(y��ng)�Æ��}
��(x��)�}�c˼��
��4�� �����|(zh��)�Y(ji��)��(g��u)�A(y��)�y
4.1 �����|(zh��)����(j��)�Y(ji��)��(g��u)�A(y��)�y
4.1.1 �����|(zh��)����(j��)�Y(ji��)��(g��u)�A(y��)�y���u(p��ng)�r(ji��)�wϵ
4.1.2 Chou-Fasman����
4.1.3 GOR����
4.1.4 PHD����
4.2 �����|(zh��)���g�Y(ji��)��(g��u)�A(y��)�y
4.2.1 ͬԴ��������
4.2.2 �ۯB�R(sh��)�e����
4.2.3 ���^�A(y��)�y����
4.3 �����|(zh��)�Y(ji��)��(g��u)�A(y��)�yܛ������
4.3.1 PHDܛ��ʹ�ú���
4.3.2 ʹ��nnpredictܛ���A(y��)�y�����|(zh��)����(j��)�Y(ji��)��(g��u) ����
��5�� �����R(sh��)�e
��6�� ������_(d��)��(sh��)��(j��)����

�ڶ����� ����W(xu��)�����
��7�� �����cDNA
��8�� �������c�����|(zh��)
��9�� �����c����M
��10�� ������Ϣ��(sh��)��(j��)��

�������� ��(sh��)�W(xu��)�����
��11�� ����Ӌ(j��)����Փ�c�㷨
��12�� ���ʡ���Ϣ�c�y(t��ng)Ӌ(j��)
��13�� �S�C(j��)�^��
��14�� ���P(gu��n)�D�c��Ļ���֪�R(sh��)
�����īI(xi��n)
����
����(sh��)�W(xu��)�c�F(xi��n)���ƌW(xu��)���g(sh��)�������ѳ����Ŀ